内蒙古自治区拥有丰富的动植物种质资源，在保障国家种业安全中具有重要地位。
近年来，内蒙古种业发展迅速，农作物良种覆盖率稳定在98%以上、畜禽良种化率达到95%以上，农作物良种繁育基地面积稳定在100万亩以上。马铃薯脱毒种薯繁育技术、规模、生产能力居全国第一，大豆制种面积居全国第三，玉米制种面积排在全国前五。自主培育向日葵品种在科研水平、市场份额及品牌价值等方面全国领先，市场占有率超过三分之一，自主培育西红柿系列品种占全国市场份额的十分之一。

内蒙古农牧厅种业管理处处长蒙志刚介绍说，内蒙古是全国培育牛羊品种最多的省区，现有国家级核心育种场11家，牛羊品种数量和供种能力均居全国首位，已具备年提供20万只种羊和1000万剂优质牛冻精的能力。培育国内排名100名以内的乳肉兼用西门塔尔种公牛达到26头，居全国首位。奶牛种业产销全国占有率第一！

2021年，内蒙古审定主要农作物品种185个，其中高淀粉玉米品种98个、高产玉米品种35个。登记非主要农作物品种71个，其中三瑞9号向日葵品种2021年推广面积在50万亩左右，杂交谷子“两优中谷2”亩产达1000斤，较常规品种增产10%左右。

  目前，自治区种业已建设重点实验室7家，土默特左旗建立种质资源库，建成7个国家级玉米、大豆、马铃薯、杂粮杂豆良种繁育基地，察右前旗、四子王旗、牙克石市建设标准化种薯基地40万亩，建成11个国家级核心育种场、5家种公牛站。